Neisseria gonorrhoeae¶
Les données de Neisseria gonorrhoeae proviennent de Pathogenwatch, qui appelle AMR et lineage génotypes (MLST, NG-MAST) à partir de génomes assemblés à partir de données publiques. Les estimations de prévalence affichées sont calculées à l’aide de collections de génome dérivées de cadres d’échantillonnage non ciblés (i. . - les études de surveillance et de chargement, par opposition aux études axées sur la RMA ou aux enquêtes sur les éclosions). Celles-ci incluent EuroGASP 2013 & 2018, et plusieurs études nationales de surveillance. Dernière mise à jour: 5 août 2025.
Définitions de variables¶
Genotypes : types de séquence du 7-locus MLST scheme pour Neisseria, ou 2-locus N. gonorrhoeae multi-antigènes typing (NG-MAST) schéma, tous deux hébergés par PubMLST.
AMR determinants are identified by Pathogenwatch using an inhouse dictionary developed and maintained in consultation with an expert advisory group, described here.
déterminants AMR dans les génotypes - Cette courbe montre les combinaisons de déterminants qui résultent d’une résistance clinique à l’Azithromycine ou à la Ceftriaxone, tel que défini dans la figure 3 de Sánchez-Busó et al (2021).
Susceptible aux médicaments I/II - Aucun déterminant trouvé pour Azithromycine, Ceftriaxone, Cefixime (catégorie I) ou Benzylpenicillin, Ciprofloxacine, Spectinomycine (catégorie II).
Abréviations¶
MDR : multirésistante (Résistance à l’une des Azithromycines / Ceftriaxone / Cefixime [représentants de la catégorie I], plus deux ou plus de Benzylpenicilline / Ciprofloxacine / Spectinomycine [représentants de la catégorie II])
XDR : grande résistance aux médicaments (Résistance à deux Azithromycines / Ceftriaxone / Cefixime [représentants de la catégorie I], plus trois de Benzylpenicilline / Ciprofloxacine / Spectinomycine [représentants de la catégorie II])
Note
Ces définitions sont basées sur celles définies dans le Plan de réponse CDC européen, modifié pour utiliser les représentants spécifiques des classes d’antibiotiques de catégories I et II qui sont disponibles dans le tableau de bord.
Source de données¶
Les données sont rassemblées à partir d’études avec les identifiants PubMed suivants :
Adhésion à l’étude |
PMID |
|---|---|
PRJEB58139 |
38614111 |
PRJEB4024 |
32013864 |
PRJEB4024 |
31358980 |
PRJNA266539 |
25378573 |
PRJNA298332 |
26935729 |
PRJEB7904 |
27638945 |
PRJNA348107 |
28510723 |
PRJEB23008 |
29523496 |
PRJEB14168 |
28348871 |
PRJNA209340, PRJNA209376, PRJNA209345, PRJNA209319 PRJJNA209352, PRJNA209333, PRJNA209347, PRJNA209316 PRJNA209466, PRJNA209373, PRJNA209465, PRJNA209351 PRJNA209342, PRJNA209343, PRJNA209320, PRJNA209470 |
25780762 |
PRJEB17738 |
29247013 |
PRJEB10104 |
29701830 |
PRJDB6504, PRJDB6496 |
30063202 |
PRJEB34425 |
32068837 |
PRJEB10016 |
32829411 |
PRJNA392203 |
29367612 |
PRJNA473385 |
29882175 |
PRJEB19989 |
31978353 |
PRJEB9227 |
29776807 |
PRJNA394216 |
29182725 |
PRJNA317462 |
30788502 |
PRJEB14933 |
26601852 |
PRJEB32435 |
33200978 |
PRJNA315363 |
27427203 |
PRJEB34425 |
32068837 |
PRJNA317462, PRJNA329501 |
32071056 |
PRJEB32435 |
32213251 |
PRJNA520805 |
31488838 |
PRJEB34068 |
35659907 |
PRJEB2999 |
24462211 |
PRJEB32435 |
32213251 |
PRJEB49317 |
35467402 |
PRJEB47922 |
35095823 |
PRJEB50649 |
37216766 |
PRJEB36607 |
32785692 |
PRJEB36608 |
30820563 |
PRJEB40983 |
33739419 |
PRJEB41007 |
34424175 |
PRJNA315363 |
27427203 |
PRJNA317462 |
30788502, 33005903, 33993166, 37171855 |
PRJNA329501 |
33005903 |
PRJNA278367 |
26358608 |
PRJNA481622 |
32977759 |
PRJNA575338 |
32868325 |
PRJNA594714 |
32571818 |
PRJNA664319 |
33760080 |
PRJNA681740 |
34280016 |
PRJNA684048 |
34683991 |
PRJNA738299 |
34755593 |
PRJNA522696 |
10.1136/sextrans-2019-054025 |
PRJNA776899 |
36735316 |
PRJNA785548 |
34978884 |